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药物是指平常的医疗用药。许多人在怀孕中还是会生病，如肠胃炎、感冒、皮肤病等等，生病的时候还是得服用药物，而且常是多种药物。国外有统计指出，90%的孕妇仍会使用药物，而且大多数药物会经过胎盘进入胎儿体内，因此，孕妇一定要对药物的影响有基本的了解。一般而言，医师对于孕妇用药是根据药物的分类来判定对胎儿的影响有多大。
临床上依照危害程度将药物分成五级，包括A、B、C、D、X级五种。“A级”表示对人类胎儿没有影响；“B级”表示对动物可能有影响，但对人类没有影响；“C级”表示对动物有影响，但人类的影响尚不清楚；“D级”对人类有影响，但是如果用药之后的好处比对胎儿的伤害大时，仍然可用。例如许多治疗癫痫的药物，孕妇有癫痫时非用此类药物不可，抗甲状腺素的药物也是如此；“X级”是确定对人类有影响，而且超过任何可能带来的好处，所以不能使用。完全不能用于孕期的药物，如一些抗癌的药，一些精神科用药、安眠药等等。所以在选择用药的时候，必须考量是哪一种类型的药及药名，而且要加以纪录，并先告知医师自己怀孕，或于怀孕后与妇产科医师说明自己的用药情形。
有些治疗青春痘的用药会造成小耳、小下巴、心脏、甲状腺及脑部之异常，不可不慎，合成的女性荷尔蒙可能造成女胎的阴道增生甚至生殖器畸形。对患有癫痫症的妇女在怀孕前，必须先转换成安全的药物之后再怀孕，因为要适应癫痫症的药通常必须使用一段时间后，才算成功，如果在怀孕后再换药可能会出现不适应的症状，因此在改换成比较安全的药物前，先不要怀孕较好。另外还有一些抗血液凝固的药物或降血压的药物，在怀孕过程中若要使用都必须谨慎小心。
以降血压的药物为例，如果使用不当，容易造成羊水过少、肾脏畸形或衰竭、肺部的发育不全、骨骼的发育不全、胎儿生长迟滞甚至造成胎儿死亡。精神科药物例如抗忧郁药物的锂盐，会造成严重的胎儿先天性心脏缺陷，所以在治疗忧郁症时也要谨慎用药。
一般来说，安眠药在怀孕中是不可使用的，因为安眠药可能会造成胎儿中枢神经及生长的异常，最好是等到不需要依赖这些药物时再怀孕比较好。
